Emil Rovner nació en Gorki (Nizhny Novgorod), Russia, en una familia de músicos. Con 10 años hizo su debut con la orquesta filarmónica de Gorki. A la edad de 16 años fue a Madrid para estudiar bajo la dirección de Ivan Monighetti (de 1991 hasta 1994), becado por Iberdrola. Despues continuó los estudios con Ivan Monighetti en Basilea y con Boris Pergamenschikow en Berlin (Hochschule für Musik Hanns Eisler). También tomò clases con Mstislav Rostropovich e estudió canto y dirección de orquesta.
En 1998 ganó el primer premio en el Concurso Bach (Leipzig), un hecho que marcó el inicio de su carrera internacional.
Recientamente hizo conciertos con la Orquesta Sinfónica de la Radio Checa, Sinonietta de Cracovia, Corean Chamber Orchestra, así como el estreno de una pieza de Gubaidulina (Festival Shostakóvich) y recitales en Prades (Festival Pablo Casals), Lucerna (KKL) y Hamburgo (Elbphilharmonie). Ha trabajado con compositores como Gubaidulina, Silvestrov y Holliger y con directores de orquesta cono Ashkenazy, Bertini, Fedoseyev, Shambadal etc..Su debut como concertista tuvo lugar con la Orquesta Zurich Tonhalle. Desde entonces ha tocado con la Filarmónica de San Petersburgo, la Sinfónica de Berlín, así como las orquestas de Stuttgart, Basilea, Múnich, etc. Desde 2007 ha sido catedtático de violoncello en la Universidad de Música Carl Maria von Weber de Dresde.