Nacido en Portugal, José Pinto empezó sus estudios musicales en su ciudad natal, Vila Real, Portugal. Su formación musical fue progresando como alumno en la Escola Superior de Música e Artes do Espectáculo en Oporto con Nuno Pinto, donde recibe sus diplomas de Superior y Master.
Posteriormente fue becado por la Fundación GDA para continuar su perfeccionamiento en la Escuela Superior Reina Sofia en Madrid con Michel Arrignon. Además ha realizado varios masterclass con clarinetistas de renombre internacional como Sabine Meyer, Yehuda Gilad, Vicente Alberola, Juan Ferrer, Karl Leister entre otros.
José Pinto ha sido premiado en varios concursos internacionales, destacamos uno de ellos como el Primer Premio en la Asociación Internacional del Clarinete en EE.UU 2014. Como solista ha participado en festivales internacionales en Portugal y España, como Klassic Fest Paços de Brandão, Festival Internacional de Clarinete
Colabora de forma activa con varias agrupaciones del ámbito orquestal como la ORCAM, Orquesta Sinfonica de Madrid, Orquesta RTVE, Orquesta Santa Cecilia, Orquesta Fundação Calouste Gulbenkian ,Orquesta XXI donde ha podido trabajar con directores como Pinchas Zuckerman, Placido Domingo, Guy Braunstein, Pablo Heras Casado.
Actualmente compagina el lado artístico con la enseñanza, formando parte del cuerpo docente del American School of Madrid.